ウチのiPad Pro12.9インチのsmart keyboardも似た症状があり、これに習いAppleサポートに連絡。（電話）
約1時間ほどのやりとりで無償交換となりました。
ちなみに購入時期はsmart keyboardが発売された時で1ヶ月待ちで到着。かれこれ2年ちょっと使っている計算ですが
それでも保証の対象になっているようです。
また到着したら再度加筆することにします。
2018/04/16加筆
情報元は下記のページ（情報感謝いたします）
アーリーテックス
Smart Keyboardが反応しない不具合が出たので、無償交換してもらった話
